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阿笠博士的金龟车在半路抛锚，导致他和灰原只能在路边等便车，碰巧这时来了一辆前往东京的车子，车主是一对古怪的情侣，并且灰原还在车内发现了弹孔和血迹，更恐怖的是她听到这对情侣说要找到柯南把他弄个半死之类的话，惊恐的灰原趁机打电话向柯南求救，没想到一直按照柯南指示的她竟然被这对情侣抓个正着，这两个人是黑暗组织成员吗？柯南又是出于什么原因让灰原和博士乖乖被抓？